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【基礎論壇】第202期-楊建益


    報告時間:2020112日(周日)下午:16:00

報告地點:沙河校區通信樓818會議室

報告題目:基于深度學習和Rosetta的蛋白質結構預測

主講人:楊建益南開大學數學科學學院國家青年特聘專家

報告摘要:

蛋白質結構預測的目標是從蛋白質的氨基酸序列出發,通過算法設計和開發,構建準確的三維結構模型红鹰彩票骗局。本報告中,我將介紹最近年來我們在蛋白質結構預測領域的主要工作trRosetta。它主要包括兩部分:(1)通過深度學習算法預測蛋白質殘基間的幾何信息;(2)把這些信息轉化為Rosetta的能量項红鹰彩票骗局,通過能量最小化方法快速從頭預測蛋白質結構。實驗結果表明trRosetta所預測的結構模型準確率高于現有其他方法,這包括第十三屆蛋白質結構預測競賽(CASP13)的冠軍AlphaFold。我們為該算法搭建了網絡服務器,還提供了可下載的版本,通過普通臺式機即可快速預測蛋白質結構:https://yanglab.nankai.edu.cn/trRosetta/。

主講人簡介:

楊建益,南開大學教授、博士生導師。2011年博士畢業于新加坡南洋理工大學红鹰彩票骗局,2011-2014在美國密歇根大學從事博士后研究工作。2015年初加入南開大學,2017年底破格晉升為教授红鹰彩票骗局。2016年成為國家青年特聘專家,2018年獲得霍英東教育基金會基金資助红鹰彩票骗局。研究方向為生物信息學,已以第一或通訊作者在Nature Methods等期刊發表SCI論文30篇。所發表論文被SCI他引3000多次红鹰彩票骗局,3篇論文入選ESI高被引論文红鹰彩票骗局。詳情請見課題組網站:http://yanglab.nankai.edu.cn/

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